截至2011年，瓜州县共有卫生医疗机构128个，其中医院2所。卫生机构床位数452张，其中医院260张。瓜州县共有卫生技术人员460人，其中执业医师及执业助理医师215人，注册护士210人。卫生防疫防治机构1个，卫生技术人员16人。妇幼卫生机构1个，卫生技术人员15人。瓜州县共有乡镇卫生院14所，床位数192张，卫生技术人员225人。农村有医疗点的村占总村数的比重达85%，有乡村医生和卫生员90人。

瓜州县三中、四中、渊小、二幼、三幼等35个教育基建项目完成投资4500万元，高考录取率达到83%，本科录取率高达42.7%。中小学"四率"均达到100%，高考专科以上上线率达到87.1%，同比2010年下降2.6%。瓜州县普通中学10所，其中，职业中学1所。初(高)中及小学在校学生23246人，普通高中招生1231人，在校学生3264人，同比2010年增长31.4%，毕业生970人。职业高中招生251人，在校学生735人，毕业生128人;初中招生2386人，在校学生7098人，初中"五合率"达到80.4%;普通小学75所，其中，不完全小学5所。小学招生1887人，在校学生12149人，同比2010年下降4.7%。城乡幼儿入园率达到100%，在园幼儿2806人，同比2010年下降7.5%;瓜州县教职工人数达到1656人，同比2010年增长1.8%(含工勤人员)。

2011年，瓜州县有5项成果获得市级科技进步奖励，其中有2项获得一等奖，2项获得二等奖，1项获得三等奖。申请受理专利32件，同比2010年增长77.8%。在申请受理32项专利中，发明专利6件，实用新型专利14件，外观设计专利2件。有7名个人申请专利29件，占申请量的90.6%，瓜州县共举办各类实用技术培训班430场次，培训乡村科技骨干3500人次，培训农业科技示范户2600户，培训农民3.25万人次，印发科技宣讲资料5.1万份，发布科技信息100多条。