喀纳斯湖位于阿尔泰山脉最高峰，海拔4374米的友谊峰脚下，是经第四纪大冰期复合谷冰川刨蚀而成，距离友谊峰20公里。周围阿尔泰山脉与蒙古、俄罗斯、哈萨克斯坦共和国三国交界，是非常重要的边界地区。喀纳斯自然保护区以喀纳斯湖风景区为中心，东西宽约74公里，新疆地处我国西北干旱荒漠区，准噶尔盆地“千里戈壁”闻名中外，而喀纳斯湖景区虽然地处准噶尔盆地北缘，和干旱荒漠连成一体，但它却森林密布，草场繁茂，反映出喀纳斯湖生物地理群落的独特性以及它在科学研究领域中的价值。喀纳斯湖是蒙古语“美丽富饶而神秘”的意思，整个风景区总面积5588平方公里，其中禁止一切生产活动的绝对保护区1885平方公里，缓冲区3707平方公里。保护区东部为布尔津河上游，西部为哈巴河上游，均为额尔齐斯河的支流。区内还有大小湖泊200多个，总面积约为100平方公里，大部分为小兵碛湖。喀纳斯湖为保护区最大的湖泊，其次是阿克库勒湖，在喀纳斯湖上游35公里，总面积约9.4平方公里，海拔约2000米。

　　喀纳斯湖自然保护区是西伯利亚泰加林带在中国唯一的延伸；是中国唯一北冰洋水系——额尔齐斯河最大的支流发源地；是中国唯一的西伯利亚动植物区系分布区；是新疆针叶林树种和野生动物种类最多、人类影响最小、原始自然状态保存最为完整的地区，国家级自然保护区。喀纳斯地理位置和自然条件优越，生物组合奇异，分布着寒温带泰加林，区内森林草原相间，群落保持完好状态，自然垂直谱明显，现代冰川保存完整，生态体系独特，自然风光优美。喀纳斯湖自然保护区属大陆性北温带寒冷气候区，由于地处欧亚大陆腹地，远离海洋，纬度教高。全国无明显的夏季，雨量充沛，光热资源也比较丰富。区内年降水量1065.4毫米，最大降水高度为2100毫米。在海拔2100米以下，降水量随海拔升高而增加，2100米以上，随海拔升高而减少。降水量从南到北逐渐增加，北部、东北部海拔高，终年冰雪覆盖，成为本区巨大的固体水库和壮观的现代冰川。喀纳斯景区的气温升降情况大致可以分为以下几个阶段：4-5月，气温回升较快，升温不稳定，多风少雨，天气多变，常出现倒春寒。一般年份4月中旬气温才稳定通过0℃，积雪开始融化，土壤开始解冻。6—7月，平均气温15℃，多阵性天气，降水频繁，气温明显升高，常有雷雨和冰雹天气发生。8—9月份，降温迅速，强冷空气开始侵入，9月初霜冻出现。10月至3月，出现漫长的严寒天气，降雪频繁，积雪深度可达1—2米。整个景区的降水量可达1000多毫米，被称为“新疆湿岛”。